食用菌產業(yè)已擠身我國農業(yè)六大產業(yè)，年產量達１２００萬噸以上，全國食用菌栽培面積以每年１５％的量持續(xù)增加，其中中溫型和高溫型品種數量增長，病蟲種類增多，侵害程度加重。據全國多點病蟲調查和分析，２００６年食用菌病蟲發(fā)生量和危害程度將在２００５年較重發(fā)生的基礎上進一步加重，各地應提早預防，減輕危害。
　　據調查，２００５年病蟲害發(fā)生種類多、受害嚴重的食用菌有雙孢蘑菇、秀珍菇、灰樹花、茶樹菇、平菇、雞腿菇、滑菇、草菇、黑木耳、姬松茸、靈芝等品種。
　　主要病蟲害有以下幾種：
　　１、菇蚊  
　　侵害食用菌的菇蚊有多種，如多菌蚊、閩菇遲眼蕈蚊、小菇蚊等，其中蘑菇、灰樹花、姬松茸、平菇、秀珍菇、黑木耳、滑菇等中低溫品種受害嚴重，杏鮑菇、雞腿菇、毛木耳、大杯蕈、金福菇等品種受害程度較輕，發(fā)生區(qū)域遍及全國各食用菌栽培區(qū)。由菇蚊侵害造成的產量損失，因品種和防治措施而異，如茶樹菇受害率達８５％，產量損失１０％～３０％；秀珍菇受害率達７０％，產量損失１５％～２０％；姬松茸受害率達６０％，產量損失１０％～２０％；雙孢蘑菇、黑木耳和毛木耳受害率５０％，產量損失１０％～１５％。
螨蟲  侵害食用菌的螨蟲因地域差異出現的種群有所不同，福建、浙江等菇場以有害長頭螨和蘭氏布倫螨為主，江蘇、安徽、四川和山東等地以腐食酪螨和上海嗜木螨為主。螨害在種植３年以上的菇房內普遍發(fā)生，其中地表層栽培的蘑菇、金針菇受害最為嚴重，其次為茶樹菇、草菇、靈芝、姬松茸、毛木耳等品種。由于用藥不當，菇房長期使用無殺螨作用的殺蟲劑，蟲源經多年的繁殖已成暴發(fā)趨勢，２００５年全國雙孢蘑菇螨蟲危害率達６０％以上，產量損失１０％～２０％以上，江蘇局部地區(qū)的金針菇、草菇、茶樹菇在菌種生產期受到螨蟲侵害而報廢。
　　２、蚤蠅 
　　受蚤蠅危害嚴重的食用菌品種有高溫出菇的平菇、秀珍菇、姬松茸、高溫蘑菇等品種，江蘇、浙江和安徽等省局部地區(qū)高溫平菇菌絲被食盡后造成絕收。
　　３、線蟲  
　　線蟲是近年來在蘑菇等草腐性品種中發(fā)生面積和危害程度快速上升的害蟲之一。由于防治藥劑選用不當使之由弱勢種群發(fā)展為優(yōu)勢種群，全國各區(qū)域的蘑菇普遍受害，產量損失１０％～３０％，甚至絕收。
　　４、疣孢霉 　
　　蘑菇受害普遍，在連續(xù)種植３～４年的菇棚內發(fā)生量大，受害嚴重，疣孢霉已成為制約我國蘑菇進一步發(fā)展的重大障礙。全國各蘑菇產區(qū)均出現疣孢霉病害，受害率達６０％以上，產量損失１０％～３０％。
　　５、細菌性病害  　
　　在高溫高濕和栽培密度大的菇棚中表現突出，受害嚴重的品種有春蘑菇、平菇中的黑色品種、金針菇，其次有黑木耳、毛木耳、滑菇等品種，病菇出現褐斑、黑斑、畸形和腐爛等癥狀。
       ６、粘菌  
       此病近年來呈上升趨勢，在平菇、茶樹菇、滑菇、毛木耳　等高溫期出菇的品種上危害嚴重。