草菇gpi基因結(jié)構(gòu)及其異核體表達(dá)協(xié)同增效作用
Volvariella volvacea Glucose-6-phosphate Isomerase Gene(gpi) Model and Synergistic Gene Expression in a Hybrid Heterokaryon

【作者】 劉朋虎； 謝寶貴； 鄧優(yōu)錦； 陳炳智； 貴甫； 朱堅(jiān)； 江玉姬； 劉新銳；

【Author】 LIU Penghu,XIE Baogui,DENG Youjin,CHEN Bingzhi,GUI Fu, ZHU Jian,JIANG Yuji,LIU Xinrui Mycological Research Center of Fujian Agricultural and Forestry University,Fuzhou,Fujian 350002,China

【機(jī)構(gòu)】 福建農(nóng)林大學(xué)菌物研究中心；

【摘要】 以草菇(Volvariella volvacea)單孢菌株P(guān)Yd21(基因組測(cè)序菌株)和PYd15(基因組重測(cè)序菌株)為材料,配對(duì)獲得可正常出菇的異核菌株H15-21?？寺y(cè)序了PYd21和PYd15的葡萄糖-6-磷酸異構(gòu)酶基因(gpi),并對(duì)基因的結(jié)構(gòu)和表達(dá)譜的表達(dá)量進(jìn)行分析。結(jié)果表明,PYd21和PYd15的gpi基因序列相同;轉(zhuǎn)錄組reads定位、paired-end分析結(jié)果顯示,gpi基因全長(zhǎng)2404bp,ORF全長(zhǎng)1659bp,編碼552個(gè)氨基酸,含有8個(gè)外顯子、7個(gè)內(nèi)含子,5’UTR長(zhǎng)度為101bp、3’UTR為183bp,RNA加工過(guò)程中有2種可變剪切類型、3個(gè)可變剪接位點(diǎn);表達(dá)譜測(cè)序結(jié)果,PYd21、H15-21和PYd15 gpi基因的表達(dá)量分別為84.53、1079.31和270.95TPM,草菇gpi基因表達(dá)表現(xiàn)出異核體表達(dá)協(xié)同增效作用,暗示著異核菌株中的2種不同來(lái)源的細(xì)胞核可能存在相互作用,這一結(jié)果在實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè)后得到證實(shí)。

【Abstract】 A hybrid heterokaryon,H15-21,was obtained by mating two single spore isolates,PYd21 and PYd15,the genomes of which were sequenced by de novo sequencing and re-sequencing,respectively.Glucose-6-phosphate isomerase genes(gpi) were cloned and sequenced from both PYd21 and PYd15,and their structures were analyzed through transcriptional read and paired-end mapping.Alignment revealed both sequences to be identical,and that gpi consisted of 2404 bp with an open reading frame(ORF) of 1659 bp encoding a...

【關(guān)鍵詞】 葡萄糖-6-磷酸異構(gòu)酶； 基因結(jié)構(gòu)； 可變剪切； 協(xié)同增效作用；

【Key words】 Glucose-6-phosphate isomerase； gene model； alternative splicing； synergistic gene expression effect；

【基金】 國(guó)家現(xiàn)代農(nóng)業(yè)產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系建設(shè)專項(xiàng)資金(編號(hào):CARS 24)的部分研究?jī)?nèi)容

【分類號(hào)】S646.13