基于rDNA-ITS序列對金針菇系統(tǒng)發(fā)育分析
Phylogeny Tree Analysis of Flammulina velutipes Based on rDNA-ITS Sequences

【作者】 金華； 鄒吉祥； 宋春鳳； 李長田； 樸仁哲；

【Author】 JI hua1,ZHOU Ji-xiang2,SONG Chun-feng3,LI Chang-tian4,PU Ren-zhe2

【機構】 大連民族學院； 延邊大學農(nóng)學院； 大連大學生命科學與技術學院； 吉林農(nóng)業(yè)大學中藥材學院；

【摘要】 以吉林地區(qū)三種金針菇以及河南產(chǎn)地的金針菇為材料,測定、分析了金針菇rDNA-ITS序列,并通過與GenBank上已登錄的金針菇ITS序列比對,采用鄰接法(Neighbor Joining,NJ)構建系統(tǒng)發(fā)育樹。結果表明,所有供試材料ITS全長在712 bp~719 bp范圍內,G+C含量在49.4%-49.9%之間,各樣品間有35個變異位點,13個信息位點,遺傳距離在0~0.014之間,其中吉林地區(qū)3種金針菇樣品部分位點發(fā)生突變,均沒有同步進化。9個金針菇樣品的ITS序列被分成了兩大組,其余樣品之間又出現(xiàn)很多分支,表明ITS可作為金針菇親緣關系鑒定的分子標記。

【Abstract】 The rDNA-ITS sequences of there kinds of Flammulina velutiper in Jilin area and Henan origin Flammulina velutiper were measured,analysed.Contrasted the sequence of Flammulina velutiper having been logged in GenBank and adopted the neighbor-joining method to construct the phylogenetic tree.The results show that the total length of all the tested material internal transcribed spacer is within the scope of 712 bp～719 bp,the content of G+C is between 49.4% ～49.9%,there are 35 variable sites and 13 i...

【關鍵詞】 金針菇； ITS序列； 克隆； 系統(tǒng)發(fā)育；

【Key words】 Flammulina velutipes； Internal transcribed spacer(ITS)； Clone； Phylogeny；

【基金】 吉林省科技廳項目(21200253)

【分類號】S646.15