【作者】 陶永新； 黃千慧； 陳仁良； 謝斌； 連玲丹； 張磊； 丁宇斯； 江玉姬； 謝寶貴； 

 

【Author】 TAO Yongxin;HUANG Qianhui;CHEN Renliang;XIE Bin;LIAN Lingdan;ZHANG Lei;DING Yusi;JIANG Yuji;XIE Baogui;College of Horticulture,Fujian Agriculture and Forestry University;Mycological Research Center,College of Life Sciences,Fujian Agriculture and Forestry University;College of Food Science,Fujian Agriculture and Forestry University;

 

【機構(gòu)】 福建農(nóng)林大學(xué)園藝學(xué)院； 福建農(nóng)林大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院菌物研究中心； 福建農(nóng)林大學(xué)食品科學(xué)學(xué)院； 

 

【摘要】 依據(jù)草菇(Volvariella volvacea)基因組和轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),采用ZOOM軟件將轉(zhuǎn)錄組Reads定位到基因組的分析方法,從草菇中鑒定了一個多糖單加氧酶基因Vv-lpmo1,對其進行生物信息學(xué)分析,并對其高效誘導(dǎo)物進行篩選,采用定量PCR方法研究其在降解稻草時表達量的變化規(guī)律。結(jié)果表明:草菇Vv-lpmo1基因DNA序列長1432bp,有9個內(nèi)含子,預(yù)測編碼305個氨基酸的蛋白質(zhì);生物信息學(xué)分析表明該蛋白質(zhì)有分泌信號肽,且含有兩個完整的保守結(jié)構(gòu)域:N端的glycoside hydrolase family 61(GH61)結(jié)構(gòu)域和C端的cellulose-binding domain(CBD)結(jié)構(gòu)域。通過對葡萄糖、無碳源(饑餓誘導(dǎo))、微晶纖維素、濾紙、稻草和木屑6種不同基質(zhì)誘導(dǎo)草菇菌絲的定量PCR,結(jié)果篩選出稻草對Vv-lpmo1基因有最強的誘導(dǎo)作用。進一步研究稻草誘導(dǎo)不同時間的變化過程中,該基因的表達規(guī)律為0~4h先下調(diào);4~12h恢復(fù)到初始水平;12h以后開始迅速上調(diào)并維持較高水平。本研究表明草菇多糖單加氧酶基因Vv lpmo1屬于誘導(dǎo)表達型基因,可能在草菇降解稻草基質(zhì)中起著重要作用。

 

【關(guān)鍵詞】 草菇； 多糖單加氧酶基因； 定量PCR； 表達量；