【作者】劉超洋 莊文穎

【機構】中國科學院微生物研究所真菌地衣系統(tǒng)學重點實驗室中國科學院研究生院 北京100039北京100080北京 100080

【摘要】本文首次利用核酸二級結構特征代替核酸堿基作為探討類群之間親緣關系的信號,構建了基于結構特征的子囊菌部分類群的系統(tǒng)進化樹。該方法以S(規(guī)范的堿基對),Q(不規(guī)范的堿基對),I(單鏈),B(側環(huán)),M(多分枝環(huán))和H(發(fā)卡結構)為代碼將二級結構特征區(qū)分為6種不同的亞結構類型,然后將二級結構特征轉換為結構序列,并進行結構序列分析。該方法使rRNA不只局限于堿基比較,拓展了其應用范圍,為揭示分子的功能與進化的關系提供了線索。結果表明,結構序列分析可用于子囊菌的系統(tǒng)學研究;相對于核酸序列分析,結構分析的結果似乎更加清晰地體現(xiàn)子囊果的演化過程。 

【基金】National Natural Science Foundation of China (no. 30230020； 30470009)；

【關鍵詞】子囊菌門; 亞結構類型; 結構序列; 系統(tǒng)演化信號;