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    金針菇基因組SSR位點分析及標記開發(fā)


    【發(fā)布日期】:2019-01-26  【來源】:食用菌學報
    【作者】金群力 沈穎越 蔡為明 周爍紅 范麗軍 馮偉林 宋婷婷 李良英 田芳芳
    【機構(gòu)】浙江省農(nóng)業(yè)科學院園藝研究所 浙江師范大學化學與生命科學學院
    摘要:以金針菇(Flammulina velutipes)基因組序列為基礎,對其SSR位點進行分析,設計16對引物對其中16個SSR位點進行標記設計,并對6個商業(yè)化的金針菇品種進行篩選。統(tǒng)計結(jié)果表明,金針菇基因組有1279個位點,SSR位點密度為35.53/Mb,并以三核苷酸基序為主,重復數(shù)≥10的SSR(即高頻)基序數(shù)目總計246個,占所有SSR位點的19.23%。設計的16對SSR標記均能擴增條帶,多態(tài)率僅為18.75%。
    基金:浙江省農(nóng)業(yè)新品種選育重大科技專項-食用菌新品種選育(2012C12911); 國家自然科學基金項目(31401930)資助;
    關(guān)鍵詞:金針菇基因組; SSR位點; 多態(tài)性標記;
     
     
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